超级病毒感染后，在不同人群产生不同的临床表现，而且病情轻重不一，绝大多数健康感染者可无任何临床症状。新生儿感染后常产生致命性的先天性巨细胞病毒感染综合症，患儿出现黄疸、肝脾肿大、多系统损害、小头畸形、运动障碍和大脑钙化等。青年人原发巨细胞病毒感染后，可出现感染性单核细胞增多症，临床表现以发热，淋巴结病变和外周血淋巴细胞计数相对增多为特征，常有轻度肝功能异常，但无黄疸。