乙肝病毒携带和小三阳的区别是：乙肝病毒携带一般是指身体携带有乙肝病毒，但是肝功能是正常的，不需要进行治疗，定期复查就可以；小三阳一般指的是乙肝表面抗原阳性，乙肝E抗体阳性和乙肝核心抗体阳性，如果出现肝功能持久性的损伤，就需要到医院进行综合性的治疗。