判断手足口病主要是从临床表现上来鉴别。在出疹期患者会出现发热及发热伴随的症状，比如咳嗽、流涕、食欲减退等；在发热的同时或者2天后在患者的手、足、臀部可以出现红色的斑丘疹，然后发展为丘疹及疱疹，疱疹的直径大多数在5mm左右，疱疹内部液体非常少或者没有；患者口腔粘膜可以出现散发的疱疹或者溃疡，大多数位于咽峡部、舌等部位，引起口腔的疼痛。