EB病毒感染主要是针对疾病本身进行治疗，如放疗、血液方面治疗，以及其他方面对症支持治疗，缺少直接抗病毒的药物。就EB病毒本身来说，感染之后并不表明一定就会发生这些疾病，它只是增加这些疾病发病的诱因或者发病风险。目前，缺乏针对病毒本身的治疗。