子宫内膜结核多由输卵管结核扩散蔓延而来。经过潜伏期，在机体抵抗力差的情况下，结核杆菌主要侵犯子宫内膜并常累及到内膜基底层。女性生殖器结核先感染输卵管，然后逐渐蔓延至子宫内膜、卵巢、宫颈等处。由于子宫内膜有周期性脱落而使内膜结核病灶随之排出，病变多局限于子宫内膜，早期呈散在粟粒样结节，极少数严重者病变侵入肌层，宫体大小正常或略小，外观无异常。