妇科支原体衣原体感染后可以出现尿频、尿急、尿道口疼痛、尿道口红肿。同时阴道会分泌物增多（呈浆液性或脓性）、阴道灼热疼痛，同房后加重。如果不及时治疗，会引起输卵管炎、盆腔炎、阴道炎。严重者还可以导致输卵管堵塞和不孕。只要支原体衣原体感染后，都需要选择敏感的药物足量治疗。由于妇科的支原体衣原体会通过性传播，所以治疗期间是禁止性生活的。