主要采取以切断传播途径主为的综合性措施。为预防水型传播，主要是保护水源，防止粪便管理；注意食品卫生，改善卫生设施和讲究个人卫生也很重要。使用丙种免疫球蛋白及人胎盘免疫球蛋白预防戊型肝炎多数报告无效。要取决于疫苗，HEV分子克隆的成功为研制疫苗提供了基础。