长期饮酒，合并有脂肪肝或使用一些对肝脏有毒性的药物等，都会导致乙肝小三阳肝功能不正常。乙肝病毒感染后的自身免疫性肝炎。这是由于感染乙型肝炎病毒后，病毒改变了肝细胞膜的一些成分，使人体的免疫系统对自身的肝细胞发动了攻击，造成肝损伤。