先天性心脏病可能是遗传因素导致的，也可能是孕期的不良因素：包括孕期孕妇的病毒感染，如风疹病毒、流感病毒等感染导致的。此外，药物、毒素等化学因素也可能导致心血管发育畸形。另外，物理因素，如放射线、强磁场、环境污染等也会影响胎儿发育，造成先天性心脏畸形。此外母体的营养不良，如糖尿病、叶酸缺乏，也会导致胎儿先心病发病率增高。