甲流通常会引起头痛的症状，可以通过服用抗病毒药物治疗或物理的方式缓解。
1、药物治疗：因为是甲流病毒感染引起的头痛，首先可以进行抗病毒治疗，可服用奥司他韦或连花清瘟等药物。其中，连花清瘟是中成药，具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，对甲型流感病毒、乙型流感病毒等多种呼吸道病毒都有抑制作用，能够治疗流感引起的头痛、发热、肌肉酸痛等不适症状。如头痛比较严重的话，也可使用解热镇痛药对症治疗，需要注意有药物联用的时候，需要在医师的指导下用药。
2、物理治疗：甲流患者常会伴有发热症状，发热也会导致头痛，所以可通过物理降温方式缓解头痛，比如用温水擦浴、睡冰枕、戴冰帽、敷退热贴等降低体温，体温降低头痛也会有所缓解。同时也可按摩头部穴位舒缓头痛。