连花清瘟胶囊可以治疗甲流。连花清瘟可清瘟解毒、宣肺泄热，对流行性感冒发热或高热、头痛、咽干咽痛、肌肉酸痛等症有效。
连花清瘟已先后34次被列入国家卫健委、中医药管理局发布的甲型流感、乙型流感、禽流感、新冠肺炎等疾病相关诊疗方案的推荐用药。
研究证实：连花清瘟在降低甲流患者疾病严重程度方面具有显著效果，连花清瘟组可显著缩短甲流患者发热、咳嗽、肌肉酸痛、乏力、头痛等流感症状持续时间，该研究还获得2011年度国家科技进步二等奖。