深呼吸肾部位隐隐作痛是由多种原因引起的，最常见的是腰肌劳损，肾盂肾炎和肾结石等，患者要及时到医院检查，确定病因后再针对性地治疗。
1、腰肌劳损：腰部肌肉和韧带及筋膜等软组织发生慢性损伤后，可导致腰肌劳损从而导致腰部酸痛，肾脏则位于腰后脊柱双侧与肋骨接近处，腰肌劳损病人深呼吸时局部肌肉有牵拉现象，疼痛会向四周放射。病人可遵医嘱服用双氯芬酸钠缓释片和布洛芬胶囊。
2、肾盂肾炎：肾盂肾炎多是由于细菌感染引起的，还与尿路梗阻和肾脏发育不良有一定的关系，致病因子的刺激可使肾脏出现酸胀钝疼的感觉，深呼吸后疼痛的症状可加重。
3、肾结石：肾结石常与代谢异常，感染相关，当病人深呼吸时可引起肾脏上下左右运动，与结石发生磨擦，可引起肾隐痛，伴血尿，气急。病人可在医师的指导下用双氯芬酸钠缓释片和硫酸阿托品片，也可按医嘱操作，例如输尿管镜碎石术和腹腔镜取石术。