神经系统的很多疾病可引起癫痫发作。常见的有中枢神经系统感染性疾病（如脑炎、脑囊虫病、脑脓肿等）、靠近大脑皮层的病变如脑梗死、脑叶出血；以及蛛网膜下腔出血、脑室出血等均可引起癫痫发作。颅内的占位性病变如脑肿瘤或者转移瘤以及颅脑病变术后，也可引起癫痫发作。一些内科系统疾病如低血糖，尿毒症性脑病，高热等均可诱发癫痫发作。