锥体外系的功能主要是辅助锥体系统来准确得完成运动。锥体外系具有调节肌张力、协调肌肉运动，维持姿势的作用。当锥体外系损伤后会出现以肌张力变化和不自主运动为主要临床表现的疾病。如帕金森病主要表现为运动减少，肌张力的增高、静止性震颤、姿势步态异常等。而小舞蹈病则表现为肌张力的降低，舞蹈样动作为其主要临床表现。