植物神经功能紊乱出现的躯体化障碍主要继发于焦虑抑郁情绪，因此治疗也是重点解决焦虑抑郁情绪。具体治疗措施包括自我调节、心理辅导、抗情绪药物治疗。自我调节关键是认识到自己的心理情绪问题，主动改善自己的情绪心情。每日规律的体育运动有助于情绪改善。同时，心理辅导非常重要，建议积极配合心理医生治疗。此外，选择合适的药物治疗方案非常重要，常用药物包括5～羟色胺再摄取抑制剂和5～羟色胺去甲肾上腺素再摄取抑制剂。