脑手术后最危险的并发症有：1、颅内感染，脑手术将颅脑封闭的环境打开，且脑手术后一般放置引流管，存在一个内外交通的通道，有颅内感染可能，一旦出现颅内感染，会严重影响病情恢复，给治疗造成困难，严重时可危及生命。2、血栓栓塞性疾病，患者术后卧床，容易出现下肢静脉血栓，若下肢静脉的血栓脱落，容易出现肺栓塞、脑栓塞，严重时可危及生命。