它的主要功能首先是体温调节功能，如果患者的下丘脑出现问题，就会出现体温难以恒定的情况，除此之外还能控制患者的产热以及散热的功能。它还能调节患者的摄食行为，有实验表明，适当的刺激该部位，有的会出现食量大增，有的会出现食量骤减的情况。同时还有腺垂体激素分泌的调节，它的有些神经元可以合成调节腺垂体激素的肽类物质。丘脑功能还包括无机盐的调节以及体内水平衡的调节。有人认为它是机体调节内分泌的枢纽，是交感和副交感中枢，也有情绪调节功能等等。