两侧太阳穴疼痛多考虑为神经血管性头痛和感冒发热引起。神经性头痛多与过度劳累，精神紧张等因素有关系，可以口服一些调节神经的药和扩张血管的药物，如谷维素、维生素B1、盐酸氟桂利嗪、尼莫地平等，也可以口服一些中成药，如养血清脑颗粒、正天丸、复方羊角片等。疼痛剧烈时，适量口服止痛药如布洛芬缓释胶囊、罗痛定等。流行性感冒引起的发热也可以引起双侧太阳穴疼痛，建议注意休息，多饮开水。服用解热镇痛药如复方盐酸伪麻黄碱缓释胶囊、重感灵片等。