脑干血栓一般不能完全恢复。首先病情危重，脑干是人体的生命中枢，支配着人体的呼吸，心脏，消化等生理功能。脑干血栓病情急迫，会直接导致患者昏迷，如果治疗不及时，会危及患者生命。其次，后遗症严重。脑干血栓的患者会造成严重的肢体功能障碍，一般的脑梗死会造成偏瘫，但是脑干血栓的患者轻者造成偏瘫，重者会造成四肢全部瘫痪，并严重影响患者的呼吸和心率。