临床上大部分留有轻微脑血栓后遗症的患者一般不会造成性功能方面的影响，但是可能会因为偏瘫等肢体功能障碍，造成性生活质量下降，次数减少，时间缩短。少部分患者由于脑梗死面积较大或严重损伤大脑神经，可能会影响性功能，造成性欲降低，勃起障碍等功能病变，这类患者临床上较为少见。病情平稳后给予积极的临床治疗和正规的康复训练，很大一部分患者仍然能够使功能恢复。