三叉神经痛从病因学角度可分为原发性和继发性两大类。原发性三叉神经痛目前认为是微血管压迫三叉神经根部导致的疼痛；继发性则是指三叉神经路径上从半月节到桥脑入口之间或其周围存在明确的器质性病变，如多发性硬化，自发性脱髓鞘，肿瘤机器性压迫或牵拉三叉神经根。现今大量临床研究发现，无论是原发性还是继发性三叉神经痛，其病因可能为多源性的，包括血管压迫刺激、神经受卡压、中枢可塑性改变引起疼痛、髓鞘退行性变和病毒感染等因素。