腔隙性脑梗死患者建议终身服用药物治疗，腔隙性脑梗死患病因素是吸烟、喝酒、肥胖、高脂血症、高血压、高血糖、心脏病、高同型半胱氨酸血症。治疗腔隙性脑梗死的同时，要预防和治疗，长期控制高血压、高血糖、高脂血症。
腔隙性脑梗死常用的药物是抗血小板聚集药物，如果没有明显的耐受性和禁忌症，可长期服用。对于不能耐受抗血小板聚集药的患者，可以先使用硫酸氢氯呲格雷片等抗血小板药物，也可以使用神经保护疗法和促进血液循环的中药治疗。