1、实验室检查：血清丙酮酸盐含量增高，血转酮醇酶活性明显降低，血液硫胺素水平明显降低。
2、脑脊液检查：正常或仅有轻度蛋白增高。
3、脑电图检查：约50%的患者脑电图异常，多见于慢性胰腺炎并发胰性脑病，表现为慢性脑病改变，无特异性，主要表现同步性θ及δ波爆发，广泛性慢波，呈轻、中度。病情痊愈后，脑电图恢复正常。
4、头颅MRI、CT检查：MRI是诊断韦尼克脑病最有价值的方法，有助于本病的早期诊断，也可用于判断预后。急性期，MRI最具特征性的表现时乳头体、丘脑、中脑导水管周围及顶盖部出现对称性异常信号，具体为T1WI低信号，T2WI、FLAIR和DWI高信号。经治疗后，MRI异常信号可消失。CT显示部分患者出现中脑导水管和第三脑室扩大，CT诊断价值不大。
5、正电子发射断层扫描检查：可用于评估丘脑损害程度，判断预后。