偏头痛的诱发因素中，内分泌因素也能导致偏头痛发作，大约60%的女性患者偏头痛发作与月经有关，偏头痛青春期女性发病率较高，有许多是在月经初期时开始出现偏头痛，而60%~80%的患者在怀孕后偏头痛发作减少甚至停止，口服避孕药加重，但在分娩后又重新发作，而在绝经期后偏头痛减轻或停止。说明偏头痛发作于雌激素，黄体酮及催乳素水平过高有关。