一般情况下，引起重度神经性头痛的疾病有很多，比如某些颅内病变引起的头痛，有脑血管疾病，比如脑膜脑炎，出血性脑血管疾病，缺血性脑血管疾病，脑动脉硬化，还有颅内肿物或者颅内压增高类疾病，比如脑瘤，颅内血肿，脑寄生虫，囊肿等，还有颅脑损伤后头痛，比如脑水肿，颅内出血，感染等，最后，还有低颅压综合征，以及癫痫也会导致重度神经性头痛。