骶管囊肿可以通过手术去除，也只有手术才能够将囊肿切除。因为囊肿本身是一种良性的病变，通过吃药是没有用的，也没有什么别的保守治疗的方法可以使囊肿消失或者缩小的。如果现在囊肿很大，对于马尾神经造成明显的压迫，引起大小便的异常或者会阴区麻木感，可以进行手术。但是如果现在囊肿很小，症状不明显，那就没有手术的必要，这也不影响健康。