肾萎缩常见于多种急慢性肾脏病的终末期、肾动脉狭窄、肾脏发育不良等疾病。导致肾萎缩的原因，各种先天肾实质疾病、继发性肾脏疾病、慢性肾盂肾炎等导致的肾脏体积缩小，功能降低。另外较为常见的原因是肾动脉狭窄、长时间未解除的尿路梗阻、肾动脉血栓形成和栓塞、反流性肾病、肾结核等。