激素治疗慢性肾炎对胃肠道、心血管系统方面、内分泌系统均有影响，长期应用肾上腺皮质激素会使体内免疫功能降低，抵抗力下降，还影响伤口愈合。在神经系统方面可有中枢抑制症状，可诱发神经精神症状，甚至发生精神失常。在眼睛，应用皮质激素可诱发白内障，可使眼压升高而发生青光眼。