肾囊肿锻炼后是不会消失的。肾囊肿可分为先天性的肾囊肿和后天性的肾囊肿两种类型。先天性的肾囊肿，是一种遗传性的疾病，因此并不会随着锻炼而消失。而后天性的肾囊肿，也不会随着锻炼消失，有的病人可能会稳定在一些大小，也有的病人会越长越大，肾囊肿如果锻炼后出现消失，有可能是因为剧烈运动以后导致肾囊肿破裂。