肾囊肿会影响肾功得能。肾囊肿直径在4cm以下的单纯性肾囊肿不会对肾脏功能造成影响。如果囊肿比较大直径超过4cm，压迫肾脏，则会对肾功能造成一定影响，但是影响也并不大。是如果是肾盂旁的肾囊肿压迫肾盂造成肾积水，或者是囊肿伴有感染后就会对肾脏功能造成明显的影响。需要在控制感染前提下进行手术治疗，解除对肾盂的压迫，缓解肾积水的问题。