发现慢性肾盂肾炎的治疗办法有：病因治疗，首先应找寻不利因素，如尿路结石、畸形、尿道颈梗阻、前列腺炎、尿道内炎症病灶、膀胱输尿管返流等，并设法纠正。一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。