胎儿肾囊肿最常见的原因就是遗传症状，有一种病，家族遗传性的肾囊肿，肝囊肿，胎儿就可以在产检时发现有胎儿肾囊肿，另外，胎儿肾囊肿的外界因素也有很多，比如在怀孕期间用的药物或者接触的化学物质环境中有毒物质，这些接触都可以导致胎儿畸形或者胎儿肾囊肿，另外，临界的作用以及个体的敏感性吸收，代谢或者胎盘的运转都会导致肾囊肿的发生。