根据提供的信息，半夜突然肚子疼拉肚子可能是由肠道疾病、急性中毒、全身性感染或甲状腺功能亢进等原因引起的。针对这种情况，需要明确病因后，再给予针对性的治疗。
如果是肠道疾病引起的急性感染性肠炎，需要给予补液、止泻、纠正水电解质紊乱治疗，同时需明确引起急性感染性肠炎的病原体。
如果是革兰氏阴性菌感染，可酌情给予喹诺酮类，如诺氟沙星等抗生素治疗。
如果是克罗恩病或者溃疡性结肠炎急性发作导致，需要给予氨基水杨酸制剂，如 5-氨基水杨酸，或者糖皮质激素进行抗炎治疗，同时需要给予补液、纠正水电解质紊乱、蒙脱石散止泻等对症支持治疗。
如果是急性中毒导致的腹痛、腹泻，患者需要尽早尽快洗胃、洗肠以及导泻，常用的导泻药物有甘露醇、山梨醇等。还需要积极纠正水电解质紊乱，有解毒剂的可给予解毒剂治疗，如铅中毒可用依地酸钙钠解毒，有些重症患者甚至可以进行肾透析治疗。
如果是全身性感染引起的，需要控制感染，可以先经验性给予抗生素治疗，待血培养结果回报后，再针对性给予敏感抗生素如左氧氟沙星、氯霉素等治疗，同时还需要给予退热、补液、纠正水电解质紊乱、营养支持等对症治疗。
如果是甲状腺功能亢进导致的，需要积极治疗原发病，包括药物治疗，放射碘 131 治疗以及手术治疗，药物包括抗甲状腺药物（如硫脲类和咪唑类）、碘剂、β受体阻断剂（如普萘洛尔）等。