肠炎患者在遵循医生的建议下，通常可以使用二代或三代头孢治疗由细菌感染引起的肠炎。但是，对于其他原因（如病毒、药物等）引发的肠炎，头孢治疗效果可能较差或无效。对于细菌性肠炎患者，喹诺酮类药物，如左氧氟沙星、诺氟沙星等，通常是更有效的治疗选择。
如果是病毒性肠炎，则应给予抗病毒药物，如阿昔洛韦进行治疗。
如果是溃疡性结肠炎，伴明显稀便或黏液脓血便，可以在医生的指导下应用头孢，同时需配合使用柳氮磺胺吡啶、美沙拉嗪、盐酸糖皮质激素等药物进行治疗。如果是放射性肠炎，需要给予止泻药物如洛哌丁胺或苯乙哌啶，以及止痛药物如阿托品等进行对症处理。
在治疗过程中，肠炎患者需要注意日常防寒保暖，避免腹部受凉，适当进行体育锻炼，增强机体免疫力。同时，饮食卫生也非常重要，避免饮用生水、食用生食，避免食用过多油腻及辛辣刺激性食物。此外，勤洗手并定期清洗、消毒盛放饭菜的餐具、冰箱以及菜板、刀具等，避免滥用影响胃肠道功能的药物也是必要的。