胃食管反流病引起的咳嗽可以使用抑酸药、促胃动力药、胃黏膜保护剂和抗焦虑抑郁药进行治疗。抑酸药包括奥美拉唑、雷贝拉唑钠等，可以通过抑制胃壁细胞的氢离子和K-ATP酶，有效抑制胃酸分泌，从而改善反酸水或者烧心的症状，减少对咽喉的刺激，改善咳嗽的情况。
促胃动力药可以使用多潘立酮、莫沙必利等，可以促进肠胃蠕动，加快胃排空，改善反酸、烧心导致的咳嗽症状。胃黏膜保护剂包括氢氧化铝、枸橼酸铋钾等，能够起到保护胃黏膜的作用，增加胃黏膜的屏障功能，缓解胃食管反流症状。抗焦虑抑郁药可以使用阿普唑仑、劳拉西泮等，由于部分患者可能合并了不同程度的焦虑或抑郁，可以在心理科医生的指导下应用。
此外，建议患者规律饮食，避免进食咖啡、浓茶、巧克力、脂肪含量过高的食物，戒烟戒酒，注意控制体重，睡前抬高床头。