半夜反酸水、呛咳等症状，可能由以下几种病因引起：
1.生理因素：如饮食不当、暴饮暴食、情绪紧张等，可导致胃内容物发酵、胃壁痉挛、胃酸分泌增加，出现反酸。建议调整饮食，适量运动，养成良好饮食习惯。
2.消化性溃疡：由胃酸分泌过多、幽门螺杆菌感染等导致胃、十二指肠黏膜受损，出现反酸、腹胀等。建议饮食清淡，避开刺激性食物。可以用质子泵抑制剂、胃保护剂等药物治疗，必要时进行内镜检查。
3.胃食管反流病：肥胖、胃内压力升高导致食管下括约肌松弛，胃内容物反流。建议控制体重，饮食不要过饱，可以用促进胃排空的药物，也可以考虑手术治疗。
此外，也应考虑其他少见病因，如反流性咽喉炎等。如果经一般治疗后症状仍无改善，应及时就诊，明确病因，遵医嘱治疗。上述药物使用需在医生指导下进行。