做一次小肠镜的费用通常在3000-10000元左右，具体费用取决于检查方式、医院的等级和所在区域等因素。电子小肠镜比胶囊内镜更昂贵，但可以选择无痛检查方式，总费用可能在11000元左右。在检查前，患者需要排空肠道和清除粪便，同时需要注意保持肠道清洁。
选择小肠镜检查方式时，应根据临床医生的建议选择合适的检查方式。