肠镜检查通常会包括肛门。结肠镜的检查范围包括盲肠、升结肠、肝曲、横结肠、脾曲、降结肠、乙状结肠、直肠和肛门。通过肛门进行检查，可以明确患者是否存在痔疮、肛裂等肛门疾病。此外，结肠镜还可以检查结肠、直肠等部位是否存在肠息肉、溃疡性结直肠炎、慢性结肠炎、肠结核、肠套叠、肠道良恶性肿瘤、缺血性肠病等多种疾病。
但是，对于一些疾病，如结肠克罗恩病，需要结合其他基础检查和肠镜辅助检查进行确诊。