咖啡灌肠是一种自然疗法，通过酸性液体刺激肠壁，促进肠道蠕动，杀死直肠中的细菌，帮助排出废物和宿便，从而解毒。咖啡因和茶碱可以扩张肠壁血管，缓和肠炎。但咖啡灌肠也有一些缺点，如会刺激肛门皮肤，使痔疮恶化，可能导致水电解质紊乱和肠道菌群失调，以及对大肠上部的有益菌不利。
因此，如果有大肠出血性伤口或存在大肠憩室等疾病，咖啡灌肠并不适合。在进行灌肠时，如果身体状况不佳或迅速排便，可能会对矿物质平衡和血液质量造成不良影响。