消化不良的大便颜色往往是由食物中的色素决定，正常人大便中的黄颜色来源于胆汁的颜色。如果各种原因导致胆汁排出不畅，会导致大便颜色变浅。此外，食物中的色素也会影响大便颜色，比如红色苋菜、红色火龙果可以使大便颜色变红。消化不良时部分叶绿素不能够被破坏，所以大便会变成绿色，其它色素也会影响此时的大便颜色。
出现大便颜色改变应当去医院就诊，在医生指导之下完善检查。消化不良是指各种原因导致胃肠道消化能力下降，消化功能可以分为物理消化与化学消化。物理消化是指食物通过牙齿的咀嚼，以及胃窦的研磨将食物变成食糜，化学性消化是指食糜在化学物质的作用下进一步分解，帮助消化的化学物质包括胆汁、胰酶。