打嗝、反酸水可能是消化不良和胃肠功能紊乱所引起，因为吃入的食物在胃中未能完全消化，停留在胃肠，进而使胃酸分泌过多，出现打嗝、反酸水。治疗时可以服用能促进消化、使胃肠功能增强的药物，并且同时服用一些缓解膈肌痉挛的药物，例如多酶片等。
打嗝、反酸水的治疗期间要注意清淡饮食，避免暴饮暴食，平时也要进行适量的运动，可以增强胃肠动力，促进饮食的消化。打嗝、反酸水的情况也可能是因为胃肠的疾病所引起，例如胃炎、十二指肠溃疡等，因为一些炎症、溃疡引起胃肠黏膜的炎症，不仅使胃肠道的刺激性加强，还会引起膈肌的痉挛，使患者不仅会出现打嗝，也会出现反酸水的情况。