注射用奥美拉唑钠在注射后身体会出现的不良反应有：1.消化系统：可有口干、轻度恶心、呕吐、腹胀、便秘、腹泻、腹痛等；丙氨酸氨基转移酶、天门冬氨酸氨基转移酶和胆红素升高也有发生，一般是轻微和短暂的，大多不影响治疗。在使用奥美拉唑长期治疗的患者的胃体活检标本中可观察到萎缩性胃炎的表现。 2.神经精神系统：可有感觉异常、头晕、头痛、嗜睡、失眠、外周神经炎等。 3.代谢/内分泌系统：长期应用奥美拉唑可导致维生素B12缺乏。 4.致癌性：动物实验表明奥美拉唑可引起胃底部和胃体部主要内分泌细胞-肠嗜铬细胞增生，长期用药还可发生胃部类癌。 5.其他：可有皮疹、男性乳腺发育、溶血性贫血等。酶系统代谢的药物（如华法林）可能有相互作用。