纤维胃镜检查有一定的痛苦，这种检查需要用软管把镜头送入胃内，并通过软管内的纤维丝传到外界。主要的痛苦是管道通过咽喉的时候，会刺激咽部，导致恶心呕吐等不适，一般过了咽部痛苦就比较小了。另外检查的时候，需要在胃内注入气体，便于观察胃壁是否有受损，可以导致腹胀等不适。目前多采用无痛胃镜的检查方法，来避免这些痛苦。