胃蛋白酶包括胃蛋白酶原Ⅰ和胃蛋白酶原Ⅱ。胃蛋白酶原Ⅱ的正常值范围为0-20ng/ml，所以不存在偏低的问题。胃蛋白酶原Ⅰ偏低时，多提示分泌的胃酸减少，且有可能存在胃黏膜腺体的萎缩，常见于消化不良、萎缩性胃炎等疾病；此外，胃蛋白酶原Ⅰ/胃蛋白酶原Ⅱ，这个比值越低，多表明幽门螺杆菌感染的区域就越大，患胃癌或胃癌前病变的可能就越大。