怀疑小儿胃肠型食物中毒时，需要收集可疑的食物以及小儿的呕吐物、粪便做细菌培养，如果分离到同一种病原体，同时结合食物中毒的发病特点（多发生于夏秋季，患儿有进食腐败、变质的食物史，并且一起就餐的人短期内集体发病）。怀疑小儿神经型食物中毒时，收集可疑的食物以及小儿的血、大便、小便均可检出肉毒梭菌，结合患儿进食了被污染的罐头、瓶装食物等，可以做出诊断。