金双歧作为一种复方益生菌制剂，在多种胃肠道疾病当中都有广泛的应用。但具体的疗程要根据治疗疾病的种类及病情程度来决定。如果治疗的是急性腹泻或者单纯性腹泻，一般是根据症状的好转程度来决定，在症状好转之后就可以停药。如果治疗的是慢性肠炎或者是腹泻型肠易激综合征，那疗程做相对较长，一般疗程是一到六个月。