无痛胃镜和普通胃镜检查都是属于侵入性检查，属于有创检查，检查过程中都有一定的风险，相对而言，无痛胃镜危险性更高。无痛胃镜检查痛苦小，检查过程无咽部对抗反射，但是无痛胃镜需要静脉推注芬太尼联合丙泊酚进行麻醉，使人进入深度睡眠状态，出现抑制呼吸，检查过程中容易出现误吸或者坠积性肺炎，危险性相对更大一些。