真菌性食管炎在食管炎当中相对少见。主要就是指真菌侵入到食管的黏膜导致食管发炎，其中最常见的是念珠菌感染引起的炎症。针对于这种情况，首先是要考虑抗真菌治疗，常用的就是制霉菌素。同时在抗真菌治疗也应该对于炎症引起的症状进行控制。可以使用磷酸铝凝胶进行保护食管黏膜，同时加用奥美拉唑或者雷贝拉唑抑酸治疗，也可以使用吗丁啉或者莫沙必利防止胃酸反流对炎症部位的刺激。