无痛肠镜全麻有风险。无痛肠镜主要是在普通肠镜的基础上，应用芬太尼联合丙泊酚静脉推注麻醉。芬太尼属于精神类药物，副作用是抑制呼吸。丙泊酚是麻醉药物，刺激血管比较明显，减慢心率，检查过程中可能出现心脏功能下降，呼吸暂停等症状。另外全麻状态下患者处于深睡眠状态，对疼痛刺激差，检查过程中可能出现穿孔风险，而不能及时察觉，延误病情。