内镜下检查幽门螺杆菌的方法主要是2种，一种是在胃镜下取组织进行快速尿素酶试验，根据快速尿素酶试验检测的结果，判断是否存在幽门螺杆菌感染。如果颜色发红，就是有幽门螺杆菌感染，但是取决于取材部位的幽门螺杆菌定植有关，如果取材部位没有幽门螺杆菌感染，那么可能会出现假(-)。另一种是在胃镜下，如果有幽门螺杆菌感染时也会表现为胃黏膜充血水肿，胃皱襞迂曲、胃液混浊，这是间接的征象，可以辅助判断是否存在感染。上述两种方法都不能作为幽门螺杆菌感染的金标准，可以进行幽门螺杆菌抗体或者是碳13、碳14呼气试验检查来明确。